Nori– Author –
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【Biopython】2本の遺伝子やタンパク質の配列間の比較（ペアワイズアライメント）[Python]
Biopython 前回、Biopythonでコドン表の表示と各生物のコドン表を使った翻訳方法を紹介しました。 今回は2本の遺伝子やタンパク質の配列を比較するペアワイズアライメントの方法を紹介します。 色々みていくうちに「Alignモジュール」を使う方法と「pairwa... -
【Biopython】コドン表の表示と各生物のコドン表を使った翻訳方法[Python]
Biopython 前回、Biopythonで相補鎖、反転配列、逆相補鎖、転写前後の配列、翻訳後の配列の取得方法を紹介しました。 今回はコドン表の表示と各生物のコドン表を使った翻訳方法を紹介します。 それでは始めていきましょう。 コドン表の表示 コドン表を表示... -
【Biopython】相補鎖、反転配列、逆相補鎖、転写前後の配列、翻訳後の配列の取得方法[Python]
Biopython 前回、Biopythonで配列ファイル（fasta、embl）の読み込みとデータの取得方法を紹介しました。 今回は相補鎖、反転配列、逆相補鎖、転写前後の配列、翻訳後の配列の取得方法を紹介します。 それでは始めていきましょう。 相補鎖、反転配列、逆相... -
【Biopython】配列ファイル（fasta、embl）の読み込みとデータの取得方法[Python]
Biopython 前回、バイオインフォマティクス用ライブラリBiopythonのインストールと配列の取り扱い方法を紹介しました。 今回はfasta形式とembl形式のファイルの読み込みとデータ取得の方法を紹介します。 それでは始めていきましょう。 Uniprotでの配列デ... -
【Biopython】バイオインフォマティクス用ライブラリBiopythonのインストールと配列の取り扱い[Python]
Biopython 前回、openCVで顔、笑顔、目を検出する方法を紹介しました。 今回からは一応大きな括りでは専門分野であるバイオ系のライブラリ「Biopython」を紹介していきます。 ただバイオ系の研究者ではあるものの、バイオインフォマティクスの研究者ではな... -
【openCV】顔、笑顔、目の検出を試してみる[Python]
openCV 前回、Pythonのプログラムやライブラリの場所を探す方法を紹介しました。 今回はopenCVに戻って、顔、笑顔、目の検出を試してみます。 それでは始めていきましょう。 学習データの場所 まずはopenCVがそれぞれのパーツを検出するための学習データが... -
【Python基礎】プログラムやライブラリの場所を探す方法
プログラムやライブラリの場所 前回、openCVで図形の輪郭を検出する方法を紹介しました。 実は次に顔検出や目検出をしていきたいのですが、その際にopenCVに付属している学習データを使います。 その学習データはopenCVなどのライブラリが保存されている場... -
【openCV】図形の輪郭を検出する方法[Python]
openCV 前回、openCVで確率的ハフ変換により直線を検出する方法を紹介しました。 今回はopenCVで図形の輪郭を検出する方法を紹介します。 使う画像は前回同様こちらの画像（shapedetection.png）です。 それでは始めていきましょう。 図形を検出：cv2.find... -
【openCV】確率的ハフ変換により直線を検出する方法[Python]
openCV 前回、openCVで円を検出する方法を紹介しました。 今回は直線を検出する方法を紹介します。 使う画像は前回同様こちらの画像（shapedetection.png）です。 それでは始めていきましょう。 確率的ハフ変換による直線の検出 直線を検出するには標準的... -
【openCV】円を検出する方法[Python]
openCV 前回、openCVでテキスト（文字列）や図形（線、矢印、四角形、丸、マーカー）を表示する方法を紹介しました。 今回はopenCVを使って円を検出する方法を紹介します。 使う画像はこちらの画像（shapedetection.png）です。 丸、線、四角で適当に作り...